Воспаление почек и мочевыводящих путей, вызванное инфекцией, часто возникает во время беременности, вероятно, по той причине, что увеличивающаяся матка замедляет выделение мочи, оказывая давление на мочеточники, соединяющие почки и мочевой пузырь. Когда поток мочи медленный, бактерии не вымываются из мочевыводящих путей, что увеличивает вероятность инфекции. Такие инфекционные поражения повышают опасность преждевременных родов и преждевременного разрыва оболочек, которые окружают плод. Иногда инфекция мочевого пузыря или мочеточников распространяется по мочевыводящим путям и достигает почек, вызывая их воспаление. Лечение заключается в приеме антибиотиков.

Некоторые инфекции могут быть опасны для плода. Такая широко известная вирусная инфекция, как краснуха, является основной причиной врожденных пороков плода, особенно его сердца и внутреннего уха. Возбудитель цитомегаловирусной инфекции иногда преодолевает плацентарный барьер и повреждает печень плода. Токсоплазмоз, вызываемый простейшими, может повреждать головной мозг плода. Беременным женщинам следует избегать контакта с кошками и их выделениями, через которые может передаваться возбудитель токсоплазмоза; это не распространяется на кошек, которые постоянно находятся дома и не контактируют с другими животными. Опасные осложнения во время беременности может вызывать инфекционный гепатит, особенно у женщин с недостаточным питанием. Возбудители инфекций могут проникать к плоду в конце беременности, что повышает вероятность преждевременных родов.

Осложнения беременности иногда вызываются болезнями, передаваемыми половым путем. Так, хламидийная инфекция может вызывать преждевременный разрыв плодных оболочек и преждевременные роды.

Инфекция вирусом иммунодефицита человека (ВИЧ-инфекция), которая вызывает СПИД, является основным осложнением при беременности: приблизительно в четверти случаев это заболевание от беременной женщины передается плоду. Больным или носителям ВИЧ-инфекции как можно раньше в течение беременности назначают зидовудин, который на две трети уменьшает вероятность передачи вируса к плоду. Если ребенок инфицирован, его состояние быстро ухудшается и он обычно умирает от осложнений СПИДа, не достигая 2-х летнего возраста. Беременность, по-видимому, не ускоряет развитие ВИЧ-инфекции у матери.

Герпес половых органов может быть передан младенцу при его прохождении через влагалище во время родов. У ребенка, инфицированного ВИЧ, при заражении герпесом обычно развивается угрожающее жизни инфекционное поражение головного мозга (герпетический энцефалит). Если у женщины в поздние сроки беременности появляются герпетические высыпания на половых органах, обычно рекомендуется кесарево сечение, чтобы предотвратить передачу вируса младенцу.