Гиполипопротеинемия - состояние, при котором понижено содержание жиров в крови - в редких случаях представляет опасность, но может быть признаком других заболеваний. Например, содержание холестерина бывает низким при избыточной активности щитовидной железы, анемии, неадекватности питания, наличии злокачественной опухоли или нарушении всасывания в желудочно-кишечном тракте (мальабсорбции). Поэтому врачи могут быть обеспокоены, если общее содержание холестерина падает ниже 4 ммоль/л.

При некоторых редких наследственных заболеваниях содержание жира оказывается настолько низким, что может иметь опасные последствия. При гипобеталипопротеинемии содержание холестерина ЛПНП чрезвычайно низкое, но обычно протекает бессимптомно, и лечение не требуется. Однако у пациентов с абеталипопротеинемией вообще нет холестерина ЛПНП и не формируются хиломикроны, что приводит к мальабсорбции (нарушению всасывания) жиров и жирорастворимых витаминов, нарушению кишечной перистальтики, стеаторее (появлению обесцвеченного дурно пахнущего кала с жирным блеском), синтезу эритроцитов с измененной формой и слепоте в результате пигментного ретинита. Хотя абеталипопротеинемию нельзя вылечить, большие дозы витаминов А и E могут отсрочить или замедлить повреждение нервной системы. Болезнь Танжеара характеризуется чрезвычайно низким содержанием холестерина ЛПВП, что ведет к нарушению функций нервов и увеличению лимфатических узлов, миндалин, печени и селезенки.